寧靖王隨著鄭成功來到台灣成為孤懸海外的明朝，但是在鄭成功、鄭經父子死後，年幼的鄭克塽投降清朝，因此寧靖王連立足之地沒有，便告訴隨侍的5位姬妾－袁氏、王氏、秀姑、梅姐、荷姐，在他死後各人可另謀生計，但是這5位姬妾均表示願追隨寧靖王而去，遂整裝後自縊於中堂，寧靖王親自為他們辦理後事，安葬於魁斗山(五妃廟現址)，於西元1683年落成。
五妃墓原是一座不封不樹的墓塋，寧靖王與五妃先後殉節後，到了西元1748年清朝乾隆年間修築墓塋並在墓前建廟祭祀，清朝光緒年間再整修一次，那時稱作五妃娘廟，又在大南門外立『五妃墓道碑』、『弔五妃墓詩』和『弔五妃墓跋』緬懷五位妃子的忠貞不渝，這座石碑現在仍保存在南門碑林中；在日據時代五妃廟亦曾整修過，近期是在1997年修復落成，並訂定為國家一級古蹟。參考資料台灣地圖導覽
